製法が異なります。
ワインビネガー ：ワインを酢酸発酵させたもの
バルサミコ・ビネガー ：ぶどう液を煮詰めたもの（モスコット）を酢酸発酵させたもの

酢酸発酵とは・・・
ビネガーとは、一言でいうとお酒のアルコールが酢酸に変化したもの。アルコールを酢酸に変化させるのが酢酸菌で、英語では「ヴィネガーマザー」と呼ばれます。糖分を酵母菌（こうぼきん）によって発酵させたものが、お酒（アルコール）。そのお酒をさらに酢酸菌によって発酵させたものが、ビネガーとなります。